伊布版独占精灵：
阿柏蛇
阿柏怪
喇叭芽
瓦斯弹
双弹瓦斯
喵喵
六尾
九尾
凯罗斯
口呆花
大食花
正如前文所述，独占精灵并不是那么重要，所以两个版本最主要的区别就是你喜欢哪个精灵做你的伙伴了。总体来说，感觉玩家对皮卡丘的接受程度更高一些，毕竟这是《精灵宝可梦》的招牌角色，而且大谷育江的萌系皮卡丘配音也将贯穿游戏的始终，光从这几点来看，皮卡丘就已经胜出了，而且作为动画版主角，皮卡丘版显得更加官方一些。
但是，之前的版本只要有机会的话相信玩家都会优先选择皮卡丘，而且皮卡丘还有一个专属的版本《精灵宝可梦：黄》，如果想要换换口味选一个新伙伴的话，伊布版就得到了一分。
本作中的伊布也非常可爱，特别是在戴着帽子和眼睛的情况下。它的声音虽然不像皮卡丘那么经典，但也非常阳光。伊布的声优是悠木碧，曾在《尼尔：机械纪元》里为帕斯卡配音，另外还拥有数之不尽的动画与游戏作品。如果在游戏里你的伊布是雌性，那么她的尾巴还将会是一个心形，这个小细节也很有趣。
说到这里大家也看出来了，说一千道一万，如何选择还是要看玩家自身的喜好，各方面的条件只是提供一定的参照。这两只主角精灵在游戏里都是无法进化的，与动画里一样，它们会拒绝进化。如果你想要雷丘或是水伊布的话，就得自己去再捉一只皮卡丘或伊布然后进化。这两种精灵在两个版本里都是可以捉到的，所以这方面不必担心。
这两只伙伴精灵在其种族里都是脱颖而出的，可以学习其它皮卡丘和伊布所不能学习的特殊招式。在游戏后期，都将成长为极其强力的精灵，比一般精灵要强得多。
这两只精灵都能学会特殊的伙伴招式，可以导致敌人陷入特殊状态效果的强力元素攻击。皮卡丘可学会三种，伊布可以学会五种。每只精灵在游戏后期所能成长到的强度取决于训练师，如何使用这些特殊招式也由训练师来决定。
如果能力和独占精灵都不是你关心的因素，那就要再找一些其它方面来判断了。你喜欢看哪只精灵的过场动画？
是皮卡丘？
还是伊布？
喜欢精灵趴在肩膀上还是头上？电系还是普通系？实在不行的话在游戏里让这两只精灵打一架决胜负，或者丢个硬币之类的。总而言之，这俩都是好游戏。
如果这些都不行，而你又实在想玩的话，那就只有最后一招了——双版本。
